El día del asesinato se vinculó a seis sospechosos, todos de nacionalidad colombiana. Esa misma noche 13 personas fueron arrestadas y procesadas por el hecho.Sin embargo, siete investigados fueron asesinados en dos cárceles mientras se realiza la investigación. Un procesado fue sobreseído antes del juicio porque no se encontraron indicios de culpabilidad.En noviembre de 2023, se informó sobre una pista importante. J.P.A.M- uno de los sicarios-, mencionó detalles sobre la planificación del crimen en el que se ofrecía USD 200 mil y que la orden salió del “Gobierno de Correa”.Este viernes 9 de agosto se cumplirá un año desde que el excandidato presidencial y activista político Fernando Villavicencio fue asesinado en un mitín político. Sin embargo, continúan las investigaciones para dar con la identidad de los autores intelectuales de este crimen.